PreBiomics Beta Program

PreBiomics Beta Program

Progetto concluso

Più di cinquanta cliniche odontoiatriche italiane hanno partecipato al progetto di ricerca promosso da PreBiomics tra il 2020 e il 2022, contribuendo alla creazione del più grande database di microbioma orale umano attualmente disponibile. L’entusiasmo, la dedizione e la passione dei Beta Tester di PreBiomics hanno fornito un impulso fondamentale, che ha permesso lo sviluppo di un approccio rivoluzionario e personalizzato per la prevenzione e per il trattamento delle malattie perimplantari.

A.P.G.R. – Roma
Dott. Giovanni Di Caccamo
Dott. Riccardo Caracci 
Studio Dentistico Associato Gobbato – Padova
Dott. Luca Gobbato
Dott. Simonetta Marchesan 
Bressan Associati Studio Dentistico – Pordenone
Prof. Eriberto BressanDott. Riccardo Martarello 
Studio Dentistico Associato Paniz – Padova
Dott. Gianluca Paniz
Dott.ssa Sofia Drivas
Dott.ssa Anna Zorzo
Dott.ssa Carola Bordin
Dott.ssa Cristina Preghel 
Centro Dentale Francesca Manfrini – Trento
Dott.ssa Francesca Manfrini 
Studio Dentistico Barcelli – Trento
Dott. Nicola BarcelliDott. Federico Folchini 
Centro Medico Odontoiatrico Torrisi – Catania
Dott. Paolo Torrisi 
Studio Dentistico Candiago – Pordenone
Dott. Jacopo Candiago
Dott.ssa Teresa Gutiérrez 
Centro Odontoiatrico Dott. Oreglia – Verona
Dott. Francesco Oreglia
Dott.ssa Silvia Tomassini
Dott.ssa Claudia Ocera
Dott.ssa Denisa Matei 
Studio Dentistico Donati – Perugia
Dott. Mauro Donati 
Centro Odontoiatrico Sforza – Bologna
Dott. Nicola Marco Sforza
Dott.ssa Mascia Ronconi
Dott. Leoluca Valeriani
Dott.ssa Anna Franchini 
Studio Dentistico Dott. Cardaropoli – Torino
Dott. Daniele Cardaropoli 
Centro Odontoiatrico Tommaseo – Trieste
Dott. Massimo Sossi
Dott.ssa Elisa Sossi
Dott.ssa Ilaria de VisintiniDott. Gianni de VisintiniDott.ssa Mirta Cozzolino
Dott.ssa Elisa Ritossa 
Studio dentistico dr Thomas Zorzi odontoiatra – Trento
Dott. Thomas Zorzi
Dott.ssa Nicoletta Corradini 
Dott.ssa Martina Stefanini – Bologna
Dott.ssa Martina Stefanini
Dott.ssa Alice Riccardi
Dott.ssa Mariam Ben Mahdhi 
Studio Dentistico Fumarola Dott. Martino – Trento
Dott. Martino Fumarola
in-4 Studio dentistico associato – Verona
Dott. Luca Landi
Dott.ssa Francesca Rizzi
Dott.ssa Sara Fontana
Dott.ssa Caterina Pagliari 
Studio Dentistico Guazzo – Vicenza
Dott. Riccardo Guazzo 
Maia Dentis – Bolzano
Dott. Antonio Bonaccorso
Dott.ssa Daniela Vicentini 
Studio dentistico Ometto – Treviso
Dott. Lucio Ometto
Dott.ssa Annachiara Trevisan 
Microdental di Dott. Giovanni Sammarco – Trento
Dott. Giovanni Sammarco
Dott.ssa Silvia Bortolotti 
Studio Dentistico Pulcini – Ascoli Piceno
Dott. Alberto Pulcini 
Oberholtzer & Martini – Vicenza
Dott. Davide Oberholtzer
Dott.ssa Alessia Colella
Dott.ssa Silvia Schiro 
Studio Dentistico Sbricoli Dott. Luca – Padova
Dott. Luca Sbricoli
Dott.ssa Silvia Bobbo
Dott. Davide Scettri
Dott.ssa Benedetta Costa 
Orizzonte Dentale – Torino
Dott. Ivan Zanini
Dott. Marco BuninoDott.ssa Simona Grosso 
Studio di Odontoiatria Ricostruttiva – Roma
Dott. Luca Landi
Dott.ssa Chiara Cappetta 
PerioDental Studio di Fabrizi Dott. Simone – Frosinone
Dott. Fabrizi Simone
Dr.ssa Gemmiti Roberta 
Studio Gatti – Milano
Dott. Claudio Gatti
Dott. Fulvio Gatti 
Poliambulatorio Gualini – Bergamo
Dott. Giacomo Gualini 
Studio Giammarini – Fermo
Dott. Andrea Giammarini 
Recchia Ambulatorio Polispecialistico- Verona
Dott.ssa Paola Chiaramonte
Dott. Giorgio Stroppa
Studio medico odontoiatrico Pellitteri Dott. Pellitteri – Bolzano
Dott. Giuseppe Pellitteri 
Studio Associato Odontoiatrico Tomasi Bottamedi Varotto – Trento
Dott. Cristiano Tomasi
Dott.ssa Sabrina BottamediDott.ssa Federica Medini 
Studio Odontoiatrico Associato Albertini Bertelle Conci – Trento
Dott. Alberto Bertelle 
Studio Carlo Ghezzi – Milano
Dott. Carlo Ghezzi 
Studio Odontoiatrico dott. Tiziano Bombardelli – Trento
Dott. Tiziano Bombardelli
Dott.ssa Maria Oros
Dott.ssa Romina Waldner 
Studio Cavalcanti & Venezia – Bari
Dott. Raffaele Cavalcanti
Dott. Vittorio Blardi
Dott.ssa Antonella Degennaro
Dott.ssa Raisa Rosioara 
Studio Odontoiatrico Dott.ssa Silvia Masiero – Varese
Dott.ssa Silvia Anna Masiero
Dott. Simone Roatti
Dott.ssa Silvia Musella 
Studio Cenzi – Vicenza
Dott. Alvise Cenzi Venezze 
Studio Odontoiatrico Dr. Donati Roberto – Trento
Dott. Roberto Donati
Dott.ssa Beatrice Marchiori
Elena Sertinean 
Studio Dentistico Associato – Dr. Broseghini M. e Dr. Dell’Acqua – Trento
Dott. Federico Dell’Acqua
Dott.ssa Serena Dell’Acqua
Dott.ssa Giulia Dalmut
Dott.ssa Karin Covi
Dott. Betim Djaferi
Dott.ssa Katarina Minarski 
Studio Odontoiatrico Guerino Paolantoni – Napoli
Dott. Guerino Paolantoni
Dott.ssa Chiara Galano Dott.ssa Elena Andolfi 
Studio Dentistico Associato Dott. Tomasi – Ghensi – Varotto – Trento
Dott. Paolo Ghensi
Dott.ssa Daniela Vicentini 
Studio odontoiatrico Piacentini – Pavia
Dott. Giacomo Piacentini
Dott. Gianluca Spinoglio 


EIC Transition - PreBiomicsPMT™

EIC Transition - PreBiomicsPMT™

Progetto in corso

IMPIANTI DENTALI: DIFFUSIONE E SFIDE CLINICHE
Gli impianti dentali sono una soluzione altamente efficace e ampiamente utilizzata nella moderna odontoiatria, con circa 30 milioni di procedure eseguite a livello globale ogni anno. Il mercato globale degli impianti dentali è stato valutato USD 5,11 miliardi nel 2025 e si prevede che raggiungerà USD 9,39 miliardi entro il 2034, con una crescita annua costante (CAGR) superiore al 7%.

Nonostante gli eccellenti risultati a lungo termine della terapia implantare, con tassi di sopravvivenza a 10 anni superiori al 95%, complicazioni tecniche e biologiche si verificano ancora in un numero significativo di casi. Tra queste, le malattie peri-implantari sono emerse come un importante problema clinico, con tassi di prevalenza comparabili a quelli delle malattie parodontali. Circa il 50% degli impianti dentali sviluppa mucosite peri-implantare, una condizione infiammatoria dei tessuti molli circostanti l’impianto causata dall’accumulo di placca batterica. Senza un intervento appropriato, la mucosite può evolvere in peri-implantite, una malattia più grave che coinvolge sia i tessuti molli che quelli duri e può portare alla perdita dell’impianto.

Nonostante l’elevata prevalenza di queste condizioni, i clinici affrontano ancora diverse limitazioni nella loro gestione. Attualmente, non esistono strumenti affidabili per valutare la gravità della malattia o prevederne la progressione, e nessun approccio terapeutico può garantire la completa risoluzione della mucosite o della peri-implantite. Di conseguenza, i professionisti dentali mancano di protocolli terapeutici standardizzati da seguire.

IL PROGETTO PREBIOMICSPMT™

Per affrontare questa sfida, il progetto PreBiomicsPMT™, finanziato dall’European Innovation Council (EIC) Transition Programme (Grant Agreement 101113004), si basa su diversi anni di ricerca condotta dal team PreBiomics sul ruolo del microbioma orale nelle malattie peri-implantari (PreBiomics Beta Program, ERC Proof of Concept – PB3P). Attraverso studi approfonditi sul microbioma effettuati prima del progetto, i ricercatori di PreBiomics hanno identificato specifiche firme microbiche associate alla salute peri-implantare, all’insorgenza della malattia e al rischio di progressione, fornendo importanti intuizioni biologiche sulle dinamiche microbiche alla base delle condizioni peri-implantari.

Partendo da questa base scientifica, il progetto PreBiomicsPMT™ è stato avviato con l’obiettivo di tradurre queste conoscenze in uno strumento clinico pratico che possa supportare i professionisti dentali nelle decisioni quotidiane. L’obiettivo è fornire ai clinici un sistema in grado non solo di supportare la diagnosi e il monitoraggio della malattia, ma anche di fornire raccomandazioni terapeutiche personalizzate basate sul profilo microbiologico di ciascun paziente, migliorando infine la gestione clinica e la longevità degli impianti dentali.
Per sviluppare questo sistema, è stato condotto uno studio prospettico multicentrico su oltre 110 cliniche dentali. I clinici partecipanti hanno raccolto campioni di placca sottogengivale e saliva, insieme a dati clinici completi, in due momenti distinti: baseline e follow-up a 6 mesi. Questo approccio longitudinale è stato essenziale per valutare l’efficacia del trattamento e gli effetti della terapia sul microbioma peri-implantare nel tempo.

Nel corso di due anni, i clinici hanno raccolto più di 6.000 campioni biologici, creando i più grandi dataset attualmente disponibili per lo studio dei microbiomi peri-implantari.

VERSO UNA GESTIONE PREDITTIVA E PERSONALIZZATA DEGLI IMPIANTI

L’analisi dei dati clinici ha confermato le sfide associate alla gestione di queste malattie. Al follow-up a sei mesi, solo il 44,9% dei pazienti con mucosite ha mostrato una completa risoluzione della malattia, mentre solo il 19% dei pazienti con peri-implantite ha evidenziato un miglioramento clinico, risultati coerenti con la letteratura scientifica attuale. In più della metà dei casi in entrambi i gruppi, la condizione clinica è rimasta stabile senza miglioramenti significativi rispetto alla diagnosi iniziale.

Integrando informazioni cliniche, storia del paziente e dati metagenomici del microbioma, il team PreBiomics ha sviluppato un Sistema di Supporto alle Decisioni (SSD) in grado di generare una classifica delle opzioni terapeutiche basata sulla probabilità prevista di successo per ciascun paziente. Parallelamente, è stata sviluppata una pipeline bioinformatica avanzata in grado di identificare geni di resistenza ad antibiotici e antisettici direttamente da campioni microbiomici complessi. Il sistema genera un resistance evidence report per i farmaci comunemente utilizzati in odontoiatria, aiutando i clinici a selezionare la terapia antimicrobica più appropriata riducendo il rischio di trattamenti inefficaci.

Con PreBiomicsPMT™, le decisioni terapeutiche possono essere guidate non solo dall’esperienza clinica o dalla gravità della malattia, ma anche dal profilo microbiologico individuale di ciascun paziente. Questo approccio aumenta la probabilità di successo terapeutico, promuove un uso più responsabile degli antibiotici e contribuisce a una gestione a lungo termine più efficace delle malattie peri-implantari.

Lista dei partecipanti

Più di 110 cliniche dentali hanno partecipato al progetto PreBiomicsPMT™, contribuendo alla raccolta di migliaia di cartelle cliniche e campioni biologici in due anni.
L’entusiasmo, l’impegno e la collaborazione dei clinici partecipanti sono stati essenziali per il successo del progetto. Il loro contributo ha reso possibile la costruzione di un dataset unico e ha svolto un ruolo chiave nello sviluppo di PreBiomicsPMT™, aiutando a trasformare anni di ricerca sul microbioma condotta da PreBiomics in uno strumento pratico per migliorare la gestione delle malattie peri-implantari.
Il team PreBiomics è sinceramente grato a tutte le cliniche che hanno partecipato allo studio per il loro supporto, la dedizione e la fiducia in questa iniziativa di ricerca.

  • PerioDental Studio Fabrizi Dott. Simone
  • Centro medico odontoiatrico Torrisi
  • Centro odontoiatrico Dott. Oreglia
  • Cos – Centro Odontoiatrico Sforza
  • Dott. Andrea Giammarini
  • Martina Stefanini
  • Microdental Dott. Giovanni Sammarco
  • Poliambulatorio Gualini
  • Studio Associato Tomasi Bottamedi Varotto
  • Studio Cavalcanti e Venezia
  • Studio dentistico associato Graiff Sivolella
  • Studio Dentistico Barcelli
  • Studio Dentistico Donati
  • Studio Dentistico Dr Manfrini Francesca
  • Studio Dr. Broseghini & Dr. Dell’Acqua
  • Studio Odontoiatrico ABC
  • Studio odontoiatrico Piacentini
  • Studio Masiero s.r.l.
  • Zorzi dr. Thomas Odontoiatra
  • Studio odontoiatrico Maurizio Lualdi
  • STUDIO DENTISTICO DR. RUGGERI MARCO
  • Studio dentistico Gasparini & Villani
  • Centro medico e dentale progetto sorriso
  • Maia dentis
  • Studio odontoiatrico Del Dot
  • Studio associato Ghensi & Varotto
  • Studio odontoiatrico Dott. Stefano Danelli
  • Studio dentistico Donati
  • Studio Odontoiatrico Dott. Tommaso Cantoni
  • Studio Odontoiatrico Colla
  • Studio Dentistico Furri
  • Studio Dentistico Associato Tobaldini Luciano e Tobaldini Alessia
  • Studio dentistico ‘Del Dente
  • Studio dentistico Vitali
  • Studio dentistico Dott. Loris Sartori
  • Studio Odontoiatrico Gatti
  • In4 Studio Dentistico Associato-Dental Group
  • Studio odontoiatrico Dott. Pompeo di Geronimo
  • Studio dentistico Alberto Bassi
  • Studio dentistico Bergo
  • Giacomo Baima – Dental School Torino
  • Simone Bossini
  • Dental Friends
  • Studio Dentistico Dr. Ceschini Massimiliano
  • Anna Bevilacqua
  • Studio Dentistico dott. Giovanni Manfrini
  • Studio Fiorile
  • Studio Dellasega
  • Studio di Odontoiatria Dott. Graffer Dott. Sciacca
  • Studio Giovannini
  • Studio Odontoiatrico Alto Garda
  • Studio odontoiatrico Dott. Marco Cinelli
  • Studio Dentistico Pellegrini
  • Università degli studi di Pavia / Studio Dott. Franco Vezzoni
  • Studio Mazzocco-Paniz
  • Studio Dentistico Dott. D’Amore Giuseppe
  • Clinica Cappellina
  • Studio Dentistico Maria Gabriella Grusovin
  • Studio Professionale di Igiene Orale
  • DENTAL AESTHETIC Dr M. Nucci
  • Studio De Mar – Clinica Odontoiatrica
  • SAN GIORGIO DENTAL CLINIC
  • Dott.ssa Stefania Morittu
  • Dott. Stefano Granelli
  • Clinica del Sorriso Thiene
  • Studio Dentistico Majoni
  • EGE UNIVERSITY
  • Clinica odontoiatrica Dott. Condorelli
  • Studio dentistico associato Blasi
  • Studio Odontoiatrico Annarumma
  • Studio di Odontoiatria dott. A. Coscarella
  • Depalo srl
  • Studio dentistico Grossi
  • Iorio Siciliano Odontoiatrica stp srl
  • Centro odontoiatrico Valsesia
  • Studio dentistico Lanzafame
  • Studio odontoiatrico Ruggeri
  • Studio dentistico Viola
  • Studio Beltempo
  • Studio Tognetti
  • Osigea Odontoiatria Roma
  • Studio Odontoiatrico Associato Moufti
  • ORIS TEAM SRL Studio Odontoiatrico
  • Santagati & Caggegi Odontoiatria SRL
  • Studio Odontoiatrico Dr. Mariconti Claudio
  • Studio Odontoiatrico Della Ciana Riccardo
  • Studio dentistico Sassudelli
  • Aemilia Medical Center
  • Università degli studi di Chieti
  • Centro Avanguardia
  • CSO centro specialistico odontoiatrico
  • Centro odontoiatrico Humanis
  • Studio dentistico Cusano Cardoni
  • San Damiano Dental
  • Paoli Dental Center
  • Studio dentistico 32 Sens
  • Studio De Mar (2) – Clinica Odontoiatrica
  • Studio dentistico Belsorriso
  • Studio dentistico Panella
  • Studio Dentistico Mattara
  • Marelli Health

Funded by the European Union. Views and opinions expressed are however those of the author(s) only and do not necessarily reflect those of the European Union. Neither the European Union nor the granting authority can be held responsible for them. Grant Agreement n° 101113004.

Scopri di più sul progetto

ERC Proof of Concept - PB3P

ERC Proof of Concept - PB3P

Progetto concluso

Valorizzando i risultati del PreBiomics Beta Program, il progetto PB3P ha utilizzato le metodologie high-throughput della metagenomica per esplorare la diversità microbica all’interno dei campioni orali.

Nel corso del progetto PB3P abbiamo identificato e isolato 100 colonie batteriche associate al batterio Fusobacterium nucleatum, il quale ha un ruolo cruciale nello sviluppo delle malattie perimplantari. Abbiamo caratterizzato le firme microbiche degli impianti dentali sani e di quelli affetti da mucosite e perimplantite, di cui le ultime composte principalmente da specie PiRC™ e da nuove specie batteriche non ancora caratterizzate. Utilizzando i genomi ricostruiti e gli isolati, abbiamo ampliato l’albero filogenetico di F. nucleatum identificando 5 diverse sottospecie e caratterizzandone i profili antibiotici e la presenza di fattori di virulenza.

Scopri di più sul progetto